在PCR擴增實驗中應注意什麼?PCR擴增過程

時間 2023-05-13 18:45:09

1樓:匿名使用者

以前反應產生的氣溶膠會成為副反應模板,必須出去,通常使用識別dutp的內切酶除去外來的模板。

注意模板的純度,通常dna,rna,甚至單個細胞都是可以作為模板的,但dna的純度可以達到很好,而rna次之,細胞的非特異性很多,建議使用dna模板。

酶需要用高保真和高速率的,推薦taq系列的,1kbp左右的速率,實驗室常用。

引物的設計,通常在20~30bp之間,退火溫度50℃~60℃,設計時保證引物的特異結合,減少非特異結合。

2樓:匿名使用者

所需的原料,酶等等,還有溫度。

pcr擴增過程

3樓:健康小馬甲

①首先是將含有待擴增dna樣品的反應混合物放置在高溫(>91℃)環境下加熱1分鐘,使雙鏈dna變性,形成單鏈模板dna;

降低反應溫度(約50℃),致冷1分鐘,使寡核苷酸引物與兩條單鏈模板dna發生退火作用並結合在靶dna區段兩端的互補序列位置上;

將反應混合物的溫度上公升到72左右保溫1-數分鐘,在dna聚合酶的作用下,從引物的3'-端加入脫氧核苷三磷酸,並沿著模板分子按5'→3'方向延伸,合成新生dna互補鏈④重複以上操作。

pcr的基本要素和擴增原理是什麼?

4樓:匿名使用者

1.基本要素和擴增原理。

基本要素與dna複製的基本要素是一致的。待拷貝的 dna 稱為模板,它可以是雙鏈 dna 也可是單鏈dna,最後擴增得到的產物是雙鏈狀態的。引物是 dna 複製的先鋒,就象結晶過程中的晶核,引導 dna 的合成。

在 pcr 擴增中一般使用合成的寡核苷酸作引物。dna 聚合酶是 dna 複製的動力,在 dntp 等底物存在時在引物的引導下沿著模板 dna 合成互補的 dna 鏈。

2.pcr 擴增的步驟。

首先將模板 dna 置於 92℃ -96℃,進行變性(denaturation)處理,使 dsdna 在高溫下解鏈成為 ssdna ,且熱變性不改變其化學性質;然後退火(annealing) ,將溫度降至 37℃ -72℃,使引物與模板的互補區相結合;最後,在 72℃ 條件下, dna 聚合酶將 dntp 連續加到引物的 3'-oh 端,合成 dna ,這個步驟稱為延伸(extension)。這三個熱反應過程的重複稱為乙個迴圈,經過 20-40 個迴圈可擴增得到大量位於兩條引物之間序列的 dna 片段。圖 5-1 所示是 pcr 反應前四輪示意圖。

如何提高擴增效率和pcr的特異性

5樓:匿名使用者

引物引物設計:引物長度適當,18-24mers,並保證序列獨特性,以降低序列在非目的片段中存在的可能性,但長度大於24核苷的引物並不意味著有更高的特異性,較長的序列可能會與錯誤配對序列雜交,反而降低特異性,而且長序列比短序列雜交慢,影響產量; 引物濃度:引物的濃度會影響特異性。

最佳的引物濃度一般在到。

較高的引物濃度會導致非特異性產物擴增。 -生物秀實驗頻道。

mg2+較高的mg2+濃度可以增加產量,但也會降低特異性。為了確定最佳濃度,從1mm到3mm,以遞增,進行最適mg2+濃度測定。

退火溫度。tm對於設定pcr退火溫度是必需的。退火溫度一般設定為比引物的tm低5℃的溫度。合理的退火溫度為55-70℃。

在理想狀態下,退火溫度應足夠低,以保證引物同目的序列有效退火,同時還要足夠高,以減少非特異性結合 --生物秀實驗頻道。

巢式pcr使用巢式引物進行連續多輪擴增,由於同兩套引物都互補的靶序列很少,巢式pcr的使用降低了擴增多個靶位點的可能性,從而提高pcr反應的特異性和靈敏度。

遞減pcr通過在pcr的前幾個迴圈使用嚴謹的退火條件提高特異性。迴圈設在比估算的tm高大約5℃的退火溫度下開始,然後每個迴圈降低1℃到2℃,直到退火溫度低於tm 5℃。這樣,特異性最高的目的模板會被優先擴增,並在隨後的迴圈中繼續擴增佔據優勢。

熱啟動pcr

通過抑制一種基本成分延遲dna合成,直到pcr 儀達到變性溫度。最常用的是熱啟動dna 聚合酶,常溫時該酶活性被抑制,94-95℃加熱數分鐘後回覆正常活力開始反應,這樣可以避免起始迴圈溫度下的非特異性擴增,大大提高了pcr反應的靈敏度及特異性。熱啟動pcr是除了好的引物設計之外,提高pcr特異性最重要的方法之一。

pcr增強劑。

包括甲醯胺,dmso,甘油,甜菜鹼等,能構降低熔解溫度,從而有助於引物退火並輔助dna聚合酶延伸通過二級結構區。

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