驗證結構基因全長,判斷是否是斷裂基因

時間 2023-06-26 21:15:02

1樓:匿名使用者

1 從基因a的3』端86個核苷酸序列和5』端54個核苷酸序列分別設計引物。

2 提取酵母dna,以該引物pcr擴增,轉殖測序,就知道基因a有多大;

3 提取酵母rna,反轉錄成cdna,已上述引物基因擴增,看擴出的cdna是否比基因組dna帶小,如過是這樣的話,說明有內含子,為斷裂基因。

2樓:匿名使用者

酵母的基因組資料ncbi裡應該有吧,把你用兩端引物擴出的序列測序用於測序,測序結果跟資料庫裡blast一下,就能知道這基因的大致資訊了,比如大小,在哪個bac上。

至於是否為斷裂基因,你知道基因的序列後,用軟體大致分析下,看看orf是怎樣的,如果orf是斷裂的,你就從**的內含子兩側設計引物,對dna和cdna分別擴增,若是擴出的片段長度有差異就能說明這基因死斷裂基因了。

3樓:匿名使用者

有點看不太懂你的問題,按照我認為得你的意思。

1.設計引物(因為你知道5『 and 3』的序列),然後就知道基因有多大。

4.把你的pcr序列放到ncbi上和你的基因序列比較,就知道有沒有不一樣(斷裂?)。

斷裂基因的基因結構

4樓:信必鑫服務平台

並非全部由編碼序列組成,而是在編碼序列中間插入了無編碼作用的鹼基序列。

真核生物的基因組非常複雜,其dna含量遠大於原核生物。由於噬菌體基因組很小,同時也編碼一些必需的蛋白質,鹼基明顯不足,使得幾乎所有的鹼基都參與編碼,而且在進化過程中也存在「重疊基因」,用有限的基因編碼更多的遺傳資訊。

相反,真核生物的基因組中含有豐富的dna,它不僅不需要「重疊基因」,而且很多序列不編碼,如重複序列、間隔序列 (spacer) 和間插序列(intervening sequence) 即內含子(intron)等,但不編碼並不意味著沒有功能。其中一些可能不知道,例如重複序列。

間插序列是指基因內部不編碼的區域,也稱內含子,一些轉錄被稱為轉錄間隔子(ts),而另一些則被稱為非轉錄間隔子(nt)。內插序列是指基因內的非編碼區,也稱為內含子,它存在於最初的轉錄中,但經過處理後會被去除,因此經常不被用作翻譯資訊。

斷裂基因的基因結構

5樓:手機使用者

真核生物的基因組十分複雜,dna的含量也比原核生物的大得多。噬菌體由於基因組很小,但又要編碼一些必不可少的蛋白,鹼基顯然不夠用,這樣不僅幾乎所有的鹼基都參加編碼,而且在進化中還出現了「重疊基因」,以有限的基因編碼更多的遺傳資訊。真核基因組正好相反,dna十分富餘,這樣不僅無需「重疊基因」,而且很多序列不編碼,如重複序列、間隔序列 (spacer) 和間插序列(intervening sequence) 即內含子(intron)等。

但不編碼並不等於沒有功能。有的我們可能還不了解,如重複序列。間隔區和間插序列這兩個概念是不同的,間隔區是指基因間不編碼的部分,有的轉錄稱轉錄間隔區(ts),有的不轉錄稱為非轉錄間隔區(nts)。

間插序列是指基因內部不編碼的區域,也稱內含子,在初始轉錄本中存在此序列,但在加工後將被切除掉,所以常不作為翻譯的資訊。間隔區常常含有轉錄的啟動子和其它上游調節序列。有的內含子也可以編碼,如成熟酶和內切酶等。

在遺傳學上通常將能編碼蛋白質的基因稱為結構基因。真核生物的結構基因是斷裂的基因。乙個斷裂基因能夠含有若干段編碼序列,這些可以編碼的序列稱為外顯子。

在兩個外顯子之間被一段不編碼的間隔序列隔開,這些間隔序列稱為內含子。每個斷裂基因在第乙個和最後乙個外顯子的外側各有一段非編碼區,有人稱其為側翼序列。在側翼序列上有一系列調控序列。

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